viernes, 22 de marzo de 2013

Proyectos para el semestre 2013-A

Proyectos de Biología 1

Modelo de Barras y bolas del aminoácidoAlanina: CH3-CH-NH2-COOH
Versión 2.11
Ultima modificación: 3013/03/30

Objetivo: Construir modelos de moléculas relevantes presentes en seres vivos, como nosotros.

Competencias

CG-4e: "Maneja las tecnologías de la información y la comunicación para
obtener información y expresar ideas.", 

CG-5f: "Utiliza las tecnologías de la información y comunicación para
procesar e interpretar información

CG-6a: "Elige las fuentes de información más relevantes para un propósito
específico y discrimina entre ellas de acuerdo a su relevancia y
confiabilidad." y 

CD-CE-9: "Diseña modelos y prototipos para resolver problemas, satisfacer necesidades o demostrar principios científicos." .

Instrucciones: Deben de construir modelos de las moléculas de las sustancias que les tocan de acuerdo a su número de proyecto. Seis moléculas en total, una de cada columna en su renglón. 

Los modelos de las sustancias de las columnas marcadas con asterisco * deben de ser modelos de bolas y barra con bolitas de unicel de (diámetro máximo 5 mm) y alambre delgado. Como la figura de arriba y la siguiente.

Modelo de bolas y barras de un ácido graso
Noten que los átomos son bolas y los enlaces son las barras. El color de las bolas indica el elemento:

  • Negro = átomo de carbono
  • Blanco = átomo de hidrógeno
  • Rojo = átomo de oxígeno
  • Azul = átomo de nitrógeno
  • Amarillo = átomo de fósforo 
  • Mostaza (o verde) = átomo de azufre  




Las sustancias marcadas con Ç deben de representarse esquemáticamente con figuras geométricas (es decir suben de nivel de organización, de modo que no se representan los átomos, sino las partes de las macromoléculas).

Por ejemplo: En vez de usar bolitas, una para cada átomo del oligopéptido (oligo- = poco; pept- = cadena de aminoácidos) de la figura de abajo. Usamos círculos de diferentes colores y el símbolo del aminoácido.

Un péptido con actividad de antibiótico
También vean la figura de abajo. Allí en el lado superior derecho se muestra esquemáticamente la doble hélice del ADN y con modelo de barras y bolas dos pares de bases. Más abajo de vuelve a mostrar el ADN esquemáticamente cómo se replica el ADN. Cada monómero se muestra con una figura más o menos arbitraria en vez de todos los átomos.




Representación esquemática del ADN



 #
Proy.
Lípido
*
Nucleótido
*
Ácido nucleico Ç
Amino-ácido *
Oligopéptido 
Ç  

Monosacárido
*
1 Acido butírico
GTP
ADN
Ala
Vasopresina
D-Gliceraldehido
2 Ácido láurico
GDP
ARN
Cis
Oxitocina
D-Eritrosa
3 Ácido mirístico
GMP
ADN
Asp
Calcitonina
D-Ribosa
4 Ácido palmítico
ATP
ARN
Glu
Ghrelina
D-Desoxirribosa
5 Ácido esteárico
ADP
ADN
Fen
Glucagon
D-Arabinosa
6 Ácido undecilénico
AMP
ARN
Gli
Insulina
D-Glucosa
7 Ácido araquídico
(eicosanoico)
AMPc
ADN
His
Neuropéptido y
D-Manosa
8 Ácido lignocérico
CTP
ARN
Leu
Vasopresina
D-Galactosa
9 Ácido cerótico
CDP
ADN
Iso
Oxitocina
Dihidroxiacetona
10 Ácido montánico
CMP
ARN
Lis
Calcitonina
D-Eritrulosa
11 Ácido palmitoleico
TTP
ADN
Met
Ghrelina
D-Ribulosa
12 Ácido oleico
TDP
ARN
Asn
Glucagon
D-Fructosa
13 Ácido eláidico (trans-oleico)
TMP
ADN
Pro
Insulina
D-Gliceraldehido
14 Ácido linoléico
dGTP
ARN
Gln
Neuropéptido y
D-Eritrosa
15 Ácido α-Linolénico
(LNA)
dGDP
ADN
Arg
Vasopresina
D-Ribosa
16 Ácido araquidónico
(eicocsatetra-enoico )
(ETA)
dGMP
ARN
Ser
Oxitocina
D-Desoxirribosa
17 Ácido eicosapentenoico
(EPA)
dATP
ADN
Tre
Calcitonina
D-Arabinosa
18 Ácido erúcico
dADP
ARN
Thr
Ghrelina
D-Glucosa
19 Ácido docosahexaenoico (DHA)
dAMP
ADN
Val
Glucagon
D-Manosa
20 Colesterol
dCTP
ARN
Tir
Insulina
D-Galactosa























Algunos enlaces útiles:

Conocimientos básicos de química
Lípidos 1
Lípidos 2