miércoles, 9 de junio de 2021

Semana 14 del semestre 2021A

 

Por M. en C. Rafael Govea Villaseñor

Versión 2.2
2019-05-16
Última modificación 2021-05-11

Chicos. 


Tienen que recordar que ustedes son tan tenaces y perseverantes como los lobos grises. Ya falta poco. Las últimas clases son cruciales. Hay que ser estratégico, centrar los esfuerzos en los temas, conceptos y hechos que no dominan. 

Apréndanlos y verifiquen el los entrenamientos que inician a las 21:15 los domingos, martes y viernes. Ya solamente restan 4.








Biodiversidad

La Clasificación de las especies de organismos que han existido y de las que aún sobreviven es un problema científico aún no resuelto del todo. Ahora sabemos que los sistemas de clasificación propuestos en el pasado no cumplen con su primera finalidad de reflejar la historia evolutiva de la Vida. 




Sin embargo, los biólogos aún no nos hemos puesto de acuerdo sobre un esquema de clasificación que refleje correctamente las relaciones evolutivas de todos los tipos de organismos y a la vez, permita una descripción nemotécnicamente eficaz de los millones de especies de seres vivos.




Se han propuesto otros esquemas de 2, 3, 4... 8 o más Reinos, pero sin alcanzar el consenso de la comunidad científica. Los primeros esquemas, como el Haeckel (1866) en el siglo 19 se han mostrado incompletos. Por ello están es desuso.



El esquema de 5 reinos de Whittaker permite conocer un panorama útil de la diversidad. Pero no es una descripción correcta de toda la Biota de la Tierra. No lo es porque no refleja correctamente la evolución de todos los linajes de organismos. Algunos linajes están sobre dimensionados y otros no son visibles, además de ser incompleto. 

Existe el esquema de 3 Dominios  de Woese (1977). Esta opción siendo correcta, no permite por si mismo visualizar con suficiente resolución toda la diversidad de la Biota.


Como ya lo mencioné, los biólogos aún no hemos llegado a un consenso sobre un sistema de taxones que describan correctamente la evolución y sirva para describir mnemotécnicamente un panorama de la biodiversidad tal como la conocemos. Por lo tanto usaremos el esquema de 5 Reinos de Whittaker (1959) para describir la biodiversidad aprovechando el nivel básico del blog y también el esquema de 3 Dominios de Woese. La representación ecléctica de Whittaker+Woese, la vemos en el siguiente esquema:




Esquema de 5 Reinos de Wittaker





Whittaker  clasificó a los organismos recurriendo primero a tres niveles de complejidad:
  • El procariótico. Por poseer células con nucleoide y por tanto, sin núcleo celular.
  • El eucariótico unicelular. Por poseer células eucarióticas (con núcleo y un extenso sistemas de endomembranas). Ademas de vivir solas enfrentando directamente el entorno y
  • El eucariótico multicelular. En este nivel, los organismos están constituidos por la asociación de muchas células nucleadas que enfrentan juntas los cambios ambientales.
 Luego, Whittaker usó el tipo de nutrición presente en cada nivel.

Ello le llevó a proponer el Reino Fungi (nutrición heterótrofa por absorción) a los reinos Animalia (nutrición heterótrofa por ingestión) y Plantae (nutrición autótrofa). Los dos últimos ya eran reconocidos desde hace siglos.

Vean los siguientes ejemplos de organismos de los reinos según Whittaker.

Reino Monera 

El reino Monera fue el primer reino en existir, de allí su nombre (mon- = uno = solitario)Este reino está formado por todos los organismos con células procarióticas, es decir con el material genético directamente en el citoplasma (nucleoide). Los organismos procarióticos pueden ser heterótrofos o autótrofos, móviles o sésiles, aerobios o anaerobios, unicelulares o multicelulares, de vida libre, simbioticos o parásitos y desintegradores o productores de materia orgánica.

Existen 2 linajes principales las Eubacterias (eu- verdadera) y Arqueobacterias (arqueo = viejo). Woese a fines del siglo pasado, propuso crear un nivel taxonomico superior, el Dominio y asignar las bacterias citadas a los dominios, respectivamente: Bacteria y Archaea.

Vean a esta eubacteria patógena unicelular en fotografía de falso color verde, se llama Staphylococcus aureus suele vivir en nuestro cuerpo como microbio amigo y tambien como patógeno:



Vean a esta eubacteria fotosintética multicelular, Anabaena:
Los heterocistos, las células verde-brillantes llevan a cabo la fijación de nitrógeno




Esta arqueobacteria llamada Methanococcus sp. es de vida libre, es un organismo anaerobio (an- = no; aero- = aire [es decir sin oxigeno] y -bio = vida, ser vivo), autótrofo (auto- = por si mismo y trof- = comer) capaz de vivir a alta temperatura en los humeros blancos submarinos:
Usa CO2 para oxidar el H2 y generar energía y CH4 como desecho



Vean a esta arqueobacteria anaerobia: Pyrococcus furiosus:
Fue descubierta en una zona volcánica. P. furiosus es un anaerobio hipertermofilo (hiper- = mucho más, termo- = calor y -filo = amor, afinidad) y usa péptidos y carbohidratos como fuente de carbonos.*
Su temperatura óptima de crecimiento es de 100º C




Reino Protista

En un tiempo se les creyó ser los primeros organismos, de allí su nombre (prot- = primero e -ista = entendido como aumentativo) es decir: los primeros. Este reino, ya había sido propuesto, pero  Whittaker lo concibió conformado por todos los organismos eucarióticos unicelulares. Esta idea resultó poco adecuada porque la multicelularidad evolucionó en muchos linajes diferentes. Lyn Margulis reunió a los grupos unicelulares con sus parientes multicelulares y denominó al reino, Protoctista (octis- = fundador, -ista = como aumentativo) significando los primerísimos fundadores.

Con todo, este reino esta deficientemente definido y suele incorporar a cualquier especie eucariótica que no cumpla con los criterios para ser considerada animal, hongo o planta verde.

Actualmente, todas las propuestas de clasificación dividen a este grupo en 6 u 8 reinos o supergrupos. Conforme avancen los estudios de secuenciación de genomas de especies claves de todos los grupos será posible llegar a un consenso. Por ejemplo. Noten que los reinos Animalia, Fungi y Plantae son solamente ramitas de estos supergrupos. Esa es una razón por la cual el esquema de 5 Reinos de Wittaker es incorrecto y deberá sustituirse por otro.
Baldauf SL 2008 An overview of the phylogeny and diversity of eukaryotes J.Sys.Ev. 46

Fabri et al 2020 The New Tree of Eukaryotes Trends of Ecol & Evol 35(1)43-55 




Los Protistas o Protoctistas pueden ser heterótrofos o autótrofos, móviles o sésiles (sesi- = sentado), aerobios o unos pocos anaerobios, unicelulares o multicelulares, de vida libre o parásitos y desintegradores, consumidores o productores de materia orgánica



Vean al protista fotosintético Pediastrum es un organismo multicelular:




Vean a Volvox otro protista fotosintético multicelular foto y gif animado:
Esta esfera hueca de hasta 50 mil células se llama Volvox

Varios ejemplares de Volvox- animado



Con todo, la mayoría de los protistas son unicelulares como este Stentor (foto y gif animado):







Reino Animalia
De los animales (anim- = ánima, animado) sólo pondré poco material porque son los organismos que más conocen. Somos organismos eucarióticos mayormente pluricelulares con nutrición heterótrofa por ingestión. Móviles y con estructuras sexuales multicelulares.

Un magnífico retrato de un chimpancé perteneciente a nuestra especie hermana:




Reino Fungi
Los hongos son mayoritariamente multicelulares (hay unicelulares) y su cuerpo se llama micelio. Son sedentarios. Vean esta fotografía de alta resolución del micelio:




El micelio (mic- = hongo) es el verdadero cuerpo de los hongos y está formado de Hifas (hif- = tejido fino o delicado), filamentos conformados por cadenas de células alargadas . A veces las hifas también se ramifican como la mostrada en la foto.





Los hongos tienen ciclos de vida cuya fase diploide existe con células dicarióticas (di- = 2 y cario- = núcleo), pues los núcleos no se fusionan como pasa con los demás eucariotes.

Las flechas blancas señalan a los 2 núcleos y las amarillas la pared entre ellas.




La multiplicación de las células ocurre en la célula final. Ambos núcleos de dividen por mitosis y luego se transfiere el segundo núcleo por un puente citoplásmico:







Noten cómo crecen las hifas por su extremo terminal:







Los hongos al tener nutrición heterótrofa por absorción suelen ser parásitos o simbiontes. Las hifas del hongo crecen entre las células de los tejidos y absorben nutrientes. Noten las hifas en el espacio intercelular:




Algo semejante ocurre en los tejidos de la mazorca del maíz cuando el hongo huitlacoche crece en ella:









Los hongos pasan en su ciclo de vida por un estado dicariótico muy visible (di- = 2 y cario- = núcleo), Lo que comúnmente llamamos hongo es sólo la estructura reproductora denominada seta conformada por células dicarióticas (que mal usamos para nombrar a un hongo comestible). Vean estas setas:
Amanita flavoconia.


O estas otras creciendo sobre materia orgánica muerta.






Reino Plantae
Las plantas (plant- = plantar, estar fijo al suelo) verdes son el último reino en evolucionar a partir de protoctistas fotosintéticos que invadieron el medio terrestre hace unos 400 millones de años. Son organismos pluricelulares con nutrición autótrofa. Sedentarios (sésiles).

Vean estas centenas de plantitas que llamamos musgos, Polytrichum commune:


Los helechos son plantas que ya tienen vasos conductores de savia.



Los pinos son ejemplo de las plantas que producen semillas desnudas:




Una tomatera es un ejemplo de una planta con flores, mismas que dan semillas dentro de frutos:



Esquema de los 3 Dominios de Woese

Al secuenciar y comparar el gen del ARN de la subunidad menor del ribosoma de una muestra de especies. Woese y sus colegas encontraron 3 linajes en toda la Vida. Dos de ellos se clasificaban como Monera y el tercer linaje contenía a los 4 reinos restantes, según Wittaker.

Tres linajes de la Vida, según Woese


Woese propuso la creación de una categoría taxonómica superior a Reino, el Dominio. A los dominios procarióticos los él les denominó Bacteria Archaea. El tercer dominio y último en surgir (cuando aparece la célula eucariótica) se llama Eukarya, mismo que como ya dijimos contiene a todos los reinos eucarióticos según Whittaker.

Versión reciente de los 3 linajes.

Distinguir a los 3 Dominios no es fácil respecto a los Dominios con morfología procariótica. En la siguiente tabla se comparan diversas características:




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*  Pyroccocus furiosus, en Microbe Wiki. visitado el 22/08/2014: https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Pyrococcus_furiosus