Proyectos para el semestre 2013-A

Proyectos de Biología 1

Modelo de Barras y bolas del aminoácido

Alanina: CH3-CH-NH2-COOH

Versión 2.11
Ultima modificación: 3013/03/30

Objetivo: Construir modelos de moléculas relevantes presentes en seres vivos, como nosotros.

Competencias: 

CG-4e: "Maneja las tecnologías de la información y la comunicación para
obtener información y expresar ideas.", 
CG-5f: "Utiliza las tecnologías de la información y comunicación para
procesar e interpretar información" 
CG-6a: "Elige las fuentes de información más relevantes para un propósito
específico y discrimina entre ellas de acuerdo a su relevancia y
confiabilidad." y 
CD-CE-9: "Diseña modelos y prototipos para resolver problemas, satisfacer necesidades o demostrar principios científicos." .

Instrucciones: Deben de construir modelos de las moléculas de las sustancias que les tocan de acuerdo a su número de proyecto. Seis moléculas en total, una de cada columna en su renglón. 

Los modelos de las sustancias de las columnas marcadas con asterisco * deben de ser modelos de bolas y barra con bolitas de unicel de (diámetro máximo 5 mm) y alambre delgado. Como la figura de arriba y la siguiente.

Modelo de bolas y barras de un ácido graso

Noten que los átomos son bolas y los enlaces son las barras. El color de las bolas indica el elemento:

• Negro = átomo de carbono
• Blanco = átomo de hidrógeno
• Rojo = átomo de oxígeno
• Azul = átomo de nitrógeno
• Amarillo = átomo de fósforo 
• Mostaza (o verde) = átomo de azufre  

Las sustancias marcadas con Ç deben de representarse esquemáticamente con figuras geométricas (es decir suben de nivel de organización, de modo que no se representan los átomos, sino las partes de las macromoléculas).

Por ejemplo: En vez de usar bolitas, una para cada átomo del oligopéptido (oligo- = poco; pept- = cadena de aminoácidos) de la figura de abajo. Usamos círculos de diferentes colores y el símbolo del aminoácido.

Un péptido con actividad de antibiótico

También vean la figura de abajo. Allí en el lado superior derecho se muestra esquemáticamente la doble hélice del ADN y con modelo de barras y bolas dos pares de bases. Más abajo de vuelve a mostrar el ADN esquemáticamente cómo se replica el ADN. Cada monómero se muestra con una figura más o menos arbitraria en vez de todos los átomos.

Representación esquemática del ADN

# Proy. Lípido * Nucleótido * Ácido nucleico Ç Amino-ácido * Oligopéptido  Ç   Monosacárido * 1 Acido butírico GTP ADN Ala Vasopresina D-Gliceraldehido 2 Ácido láurico GDP ARN Cis Oxitocina D-Eritrosa 3 Ácido mirístico GMP ADN Asp Calcitonina D-Ribosa 4 Ácido palmítico ATP ARN Glu Ghrelina D-Desoxirribosa 5 Ácido esteárico ADP ADN Fen Glucagon D-Arabinosa 6 Ácido undecilénico AMP ARN Gli Insulina D-Glucosa 7 Ácido araquídico (eicosanoico) AMPc ADN His Neuropéptido y D-Manosa 8 Ácido lignocérico CTP ARN Leu Vasopresina D-Galactosa 9 Ácido cerótico CDP ADN Iso Oxitocina Dihidroxiacetona 10 Ácido montánico CMP ARN Lis Calcitonina D-Eritrulosa 11 Ácido palmitoleico TTP ADN Met Ghrelina D-Ribulosa 12 Ácido oleico TDP ARN Asn Glucagon D-Fructosa 13 Ácido eláidico (trans-oleico) TMP ADN Pro Insulina D-Gliceraldehido 14 Ácido linoléico dGTP ARN Gln Neuropéptido y D-Eritrosa 15 Ácido α-Linolénico (LNA) dGDP ADN Arg Vasopresina D-Ribosa 16 Ácido araquidónico (eicocsatetra-enoico ) (ETA) dGMP ARN Ser Oxitocina D-Desoxirribosa 17 Ácido eicosapentenoico (EPA) dATP ADN Tre Calcitonina D-Arabinosa 18 Ácido erúcico dADP ARN Thr Ghrelina D-Glucosa 19 Ácido docosahexaenoico (DHA) dAMP ADN Val Glucagon D-Manosa 20 Colesterol dCTP ARN Tir Insulina D-Galactosa
Algunos enlaces útiles: Conocimientos básicos de química Lípidos 1 Lípidos 2